在申报公路工程设计乙级资质过程中，如果发现提交的资料不符合要求，补正材料的具体步骤通常包括：
确认问题：
首先，收到审查部门的通知或反馈后，仔细阅读并理解指出的问题所在，明确需要补正的具体内容和原因。
收集补充材料：
根据通知中的要求，重新整理、收集或者补充符合标准格式和要求的相关文件、证书、业绩证明等材料。
核实准确性：
对于需要修改或补充的材料，再次核实其真实性、完整性和有效性，确保所有信息准确无误。
准备说明文档：
如有必要，编写一份针对补正情况的详细说明，阐述问题出现的原因以及如何进行整改的过程。
正式提交补正材料：
将补正后的全套材料按照规定的方式和时间期限内递交给负责审批的交通行政主管部门或其指定的在线服务平台。
跟踪处理结果：
在提交补正材料后，保持与审核机构的沟通，及时了解补正材料是否通过审核，如有必要可能还需要进一步补充或修正。
总之，企业在遇到申报资料不符合要求的情况时，应尽快对照资质标准和相关法规，全面细致地核查资料，并积极与相关部门沟通协调，确保在规定的时间内完成补正工作。
